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科研效率提升:918博天堂超高活性Tn5一步法文库制备全攻略

来源:包毓伦 日期:2025-03-16

文库制备是生物医学研究中重要的步骤,尤其是在进行基因组测序和转录组分析时。传统的文库制备方法通常依赖于连接酶,整个过程包含多个繁琐的步骤:首先通过机械(例如超声破碎)或酶切手段对DNA进行片段化,接下来进行末端修复,最后完成接头的连接。虽然这种方法在大多数情况下有效,但在面对有限的样本量或实验资源(如设备和时间)时,常常会遇到瓶颈。

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为了解决这一问题,基于Tagmentation技术的文库制备方法得到了广泛应用。该技术运用了超活性Tn5转座酶,当携带特定的寡核苷酸时,可以在单次快速反应中实现对DNA的剪切和标记。根据实验需求,Tn5转座酶可以搭载多种DNA序列,包括兼容Illumina的接头、自定义的荧光标记接头等。基于Tagmentation的建库方案革命性地将传统方法中的片段化、末端修复和接头连接步骤整合为单一反应,随后可以进行引物索引的扩增,顺利完成文库制备。

这一突破不仅大幅简化了操作流程,还显著提升了实验的效率和通量。通过将DNA片段化与接头插入步骤合二为一,整个文库制备流程得以简化,操作时间也大幅缩短,同时降低了技术复杂性。

这种方法的普适性使其适合于全基因组测序、靶向测序以及其他多种建库场景,能够灵活适配不同的实验设计需求。同时,单步反应取代了多环节操作,使得建库速度较传统方法有了显著提升。尤其是在珍贵的临床样本或微量样本的处理中,该方法对于起始样本量的需求相对较低。此外,成本方面通过减少操作步骤和试剂消耗,整体建库成本也得到了降低。而且,操作的简便性和步骤的减少,使得自动化变得更加容易,从而显著提升高通量测序的通量与可重复性。

在具体应用中,例如spatial-ATAC-seq方法,可以对完整组织切片中的染色质可及性进行空间分辨分析,并且保留细胞级别的空间信息。在这一协议中,使用了Diagenode Tn5转座酶进行文库的制备。另外,sci-RNA-seq技术则通过核酸的split-pool条形码标记,简化并优化了单个细胞的转录组分析。

Diagenode的Tn5转座酶及相关缓冲液具有很高的通用性,兼容多种应用场景,包括新型的条形码技术(如单细胞多重测序、空间组学等),可以灵活适应不同的实验需求。该品牌还提供两种版本的接头,一种是预加载的Illumina兼容接头,另一种则允许用户自行添加接头,确保最大程度的灵活性。同时,所有产品都经过严格的质量控制,以保证达到最高标准。

918博天堂作为表观遗传学及二代、三代测序前样本处理的领先品牌,致力于为生物医学研究提供创新的解决方案。公司自2003年在比利时成立以来,一直专注于提供高品质的仪器、试剂盒及抗体产品,旨在简化DNA甲基化、ChIP以及ChIP-seq的工作流程。

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